PiVAT(The Pillar Variant Analysis Toolkit)是智能化生物信息分析软件系统,全Web界面,一步完成从测序原始数据(bcl或fastq)到突变列表的全部分析工作。与基于SLIMamp的NGS检测互相补充,可得到精准可靠的突变分析结果。PiVAT软件包可以部署在云端或本地,用于处理标准的FASTQ文件格式数据。
PiVAT提供了一个标准得BAM(Binary Alignment Map)文件,同时也提供了一个PBAM的PiVAT版本。两者在标准生物信息流程中可以互换。通过局部比对或者从头合成序列拼接可以检测到较长的indels,同时抑制了因富集和分析方法导致的错误。